サイドプランシナリオ
- 分岐ルート1：第01話 ～ 第02話
- 共通ルート1：第03話 ～ 第07話
- 分岐ルート2：第08話
- 共通ルート2：第09話 ～ 第11話＋シークレット
- 分岐ルート3：第12話 ～ 第13話
- 共通ルート3：第14話 ～ 第15話
- 分岐ルート4：第16話 ～ 第20話
- 共通ルート4：第21話 ～ 第25話
- 分岐ルート5：第26話＋シークレット
- 共通ルート5：第27話 ～ 第29話
- 分岐ルート6：第30話 ～ 第32話
- 共通ルート6：第33話 ～ 第34話＋シークレット
- 分岐ルート7：第35話 ～ 第36話
- 共通ルート7：第37話 ～ 第41話
- 分岐ルート7：第42話＋シークレット
- 分岐ルート8：第43話 ～ 第45話
- 共通ルート8：第46話 ～ 第50話＋シークレット
- 分岐ルート9：第51話 ～ 第54話
分岐ルート1：第01話 ～ 第02話
スペシャルシナリオにはサイドプランシナリオなし。
男主人公ルート1
第01話 プロジェクトTND始動
（サイドプランシナリオはなし）
第02話 宇宙のカウボーイ
スパイクで敵を3体以上撃破（TacP100）
女主人公ルート1
第01話 特務三課、始まるりの日
（サイドプランシナリオはなし）
第02話 賞金稼ぎのブルース
スパイクで敵を3体以上撃破（TacP100）
共通ルート1：第03話 ～ 第07話
第03話 タキシードは火星に舞う
2パターンあり。
- ドモンだけでチボデーを撃破する（資金20000）
- ドノン以外がチボデーを撃破する（資金10000）
第04話 戦いの赤い荒野
アキトが北辰六人衆（1体だけでOK）を撃破する（TacP100）
第05話 キャプテンハーロック
ジョルジュがドモンを援護攻撃 or 援護防御する（資金10000）
第06話 ドクロの旗の下に
スパイクがビバップ・フォーメーションIで敵を撃破する（TacP100）
第07話 復讐するは我にあり
アレンビーとプリシラがそれぞれ敵を1体以上撃破する（資金10000）
分岐ルート2：第08話
男主人公ルート2
第08話 スクランブル・マーズ
主人公でルーディーを撃破する（TacP100）
女主人公ルート2
第08話 マーズ・ラプソディ
主人公でルーディーを撃破する（TacP100）
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共通ルート2：第09話 ～ 第11話＋シークレット
第09話 ゲイトウェイ・チェイス
後半戦で敵を全滅させてシナリオクリア（資金10000）
第10話 ネオ・ジオンの影
ヴァンが敵を2体以上撃破する（TacP100）
第11話 遠い星から来た災厄
凱とジュドーがそれぞれ敵を2体以上撃破する（資金10000）
シークレット 正義と勇気を友にして
シナリオクリアで自動的に達成（TacP300）
分岐ルート3：第12話 ～ 第13話
地上ルート
第12話 無敵！勇気ある者達！
凱と舞人がそれぞれ敵を2体以上撃破する（資金10000）
第13話 復活のZ
甲児登場後、シローが敵を1体以上撃破する（TacP100）
宇宙ルート
第12話 ロンド・ベル孤立
ジュドーが登場する前にルー、ビーチャ、モンド、エル、イーノがそれぞれ敵を1体以上撃破する（資金10000）
第13話 ハマーンと少年達
ハマーンを撃破する（TacP200）
共通ルート3：第14話 ～ 第15話
第14話 最凶の降臨
凱と東方不敗が戦闘をする（TacP100）
第15話 空が落ちる日
超竜神が出撃している状態で、撃竜神が敵を撃破する（資金10000）
分岐ルート4：第16話 ～ 第20話
治安維持隊ルート
第16話 門が開く時
主人公でロニーを撃破する（TacP100）
第17話 バランバランの秘宝
凱か舞人のいずれかが敵を2体以上撃破する（TacP100）
第18話 魔法騎士、その使命
シオンとトッドが戦闘をする（TacP100）
第19話 目覚める伝説
光、海、風のいずれかがイノーバと戦闘する（資金10000）
第20話 黒い野望
トッドを撃破してイベントを発生させる（TacP100）
- HPを減らしてイベントを発生させるのはNG。
自由遊撃隊ルート
第16話 星の門
主人公でロニーを撃破する（TacP100）
第17話 バトリング
ヴァンが敵を2体以上撃破する（TacP100）
第18話 電脳世界から
スパイクとアンジェラが戦闘し、両者ともに生存する（TacP100）
- アンジェラはHP6割で撤退する。
第19話 ビッグバトル
4ターン目までにすべてのファッティーがラインを超える（資金10000）
第20話 星の果ての楽園
アンジェラが敵を2体以上撃破する（TacP100）
共通ルート4：第21話 ～ 第25話
25話は特典DLCの有無でタイトルが異なるが条件自体は同じ。
第21話 小さな火を胸に
イーファス（ポール）を1度撃破後、撤退させずに再度撃破する（TacP100）
- 2回目はHP50%以下でイベント発生（撤退）するので注意。
第22話 戦いは誰がために
アキトと北辰が戦闘をする（資金10000）
第23話 毒と毒と毒
Jが敵を3体以上撃破する（TacP100）
第24話 帰らざる日々
光、海、風のいずれかがイノーバと戦闘する（資金10000）
DLC有：第25話 プロジェクトTND凍結
初期配置の敵を全滅させた際に、主人公の撃破数がサブ主人公よりも多い（TacP100）
DLC無：第25話 特務三課、終わりの日
主人公の撃破数がサブ主人公よりも多い（TacP100）
分岐ルート5：第26話＋シークレット
男主人公ルート3
第26話 会社と人と誇りと
主人公でルーディーを撃破する（TacP100）
シークレット：プライベート・ミッション
シナリオクリアで自動的に達成（TacP300）
シークレット：プライベート・ミッション
シナリオクリアで自動的に達成（TacP300）
女主人公ルート3
第26話 会社と私と幸せと
主人公でルーディーを撃破する（TacP100）
共通ルート5：第27話 ～ 第29話
第27話 楽園と追放者
アンジェラとニーバが戦闘する（資金10000）
第28話 決戦の火星極冠遺跡
アキトが北辰をディストーションアタックSで撃破する（TacP100）
第29話 それぞれの誇り
光の攻撃でイーグル(FTO)のHPを1万以下にしてイベントを発生させる（資金10000）
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分岐ルート6：第30話 ～ 第32話
正規部隊ルート
第30話 少年は振り向かない
味方部隊登場後にアムロで敵を2体以上撃破する（TacP100）
第31話 不安と恐れの行き先
シオンとトッドの両者がアレンと戦闘をする（TacP100）
第32話 聖戦士、飛ぶ
ショウとシオンがそれぞれ敵を2体以上撃破する（資金10000）
非正規部隊ルート
第30話 水の一滴の向こう
アキトと主人公の両者が東方不敗と戦闘をする（TacP100）
第31話 ゆがんだ進化
アンジェラがメタルビーストを2体以上撃破する（資金10000）
第32話 闇に蠢く
シャッフル同盟の各メンバーがスーパーモードの必殺技を使用する（TacP100）
- 対象の武器
- 豪熱マシンガンパンチ
- 真・流星胡蝶剣
- ローゼスハリケーン
- 炸裂ガイアクラッシャー
共通ルート6：第33話 ～ 第34話＋シークレット
第33話 誓いのガンダムファイト
アレンビーが敵を2体以上撃破する（資金10000）
第34話 終焉の日
光、海、風の全員がザガートと戦闘する（TacP100）
シークレット：Vジャンクション
シナリオクリアで自動的に達成（TacP100）
分岐ルート7：第35話 ～ 第36話
地球ルート
第35話 無限の地獄
光攻撃時にランティスが援護攻撃する（TacP100）
第36話 光の子の力
シローがブロッケンとINFINITYの両方と戦闘する（資金10000）
宇宙ルート
第35話 アクシズ激震
ジュドーでプルツーを説得する（TacP100）
第36話 二つのネオジオン
ルーとプルツーが戦闘をする（資金10000）
共通ルート7：第37話 ～ 第41話
第37話 月面の激闘
Jが敵を2体以上撃破する（TacP100）
第38話 太陽系絶対防衛線
ノリコがスーパーイナズマキックで敵を撃破する（TacP100）
第39話 眠る光、目覚める闇
舞人がダブル動輪剣で敵を撃破する（資金10000）
第40話 天翔る真龍
武蔵（ゲッター3）で戦闘をする（TacP100）
第41話 みんなのしあわせ
ハーロックとファサリナが戦闘する（資金10000）
分岐ルート7：第42話＋シークレット
男主人公ルート4
第42話 最後のVTX魂
ワシールを主人公のクォーク・クラスター・ノヴァで撃破する（TacP100）
シークレット：来訪者X
シナリオクリアで自動的に達成（TacP100）
女主人公ルート4
第42話 託される意志
ワシールを主人公のクォーク・クラスター・ノヴァで撃破する（TacP100）
シークレット：来訪者X
シナリオクリアで自動的に達成（TacP100）
分岐ルート8：第43話 ～ 第45話
シャア共闘ルート
第43話 シャアの思惑
シャア、ギュネイ、クェスがそれぞれ敵を1体以上撃破する（TacP100）
第44話 ハマーンの涙
シャア、ギュネイ、クェスがそれぞれ敵を1体以上撃破する（TacP100）
第45話 アクシズの決戦
プルツーポイント6点以上、シャアポイント6点以上が条件（TacP300）
ハマーン共闘ルート
第43話 悲しき迷い子
カミーユとギュネイが戦闘する（TacP100）
第44話 愛憎の果てに
ハマーンがサザビーとナイチンゲールの両方と戦闘する（TacP100）
第45話 戦士、再び
プルツーポイント6点以上、シャアポイント6点以上が条件（TacP300）
独自ルート
第43話 混沌の宇宙
カミーユとギュネイが戦闘する（TacP100）
第44話 サイレント・ヴォイス
ハマーン（味方ユニットになった後）が敵を2体以上撃破する（資金10000）
第45話 堕ちた赤い彗星
プルツーポイント6点以上、シャアポイント6点以上が条件（TacP300）
共通ルート8：第46話 ～ 第50話＋シークレット
第46話 闘志、氷原に燃ゆる
東方不敗ポイント6点以上が条件（TacP300）
シークレット：流浪のハマーン
シナリオクリアで自動的に達成（TacP300）
シャアが敵を3体撃破していると追加報酬（TacP200）
第47話 鋼鉄の7人
敵を全滅させてクリアする（TacP100）
第48話 絶望を望むもの
ランティス、海、風のいずれかがノヴァと戦闘をする（TacP100）
第49話 果てしなく広がる未来へ
デボネアを光の閃光の剣で撃破する（資金3万）
第50話 神の見えざる意志
キリコがワイズマンを撃破する（TacP100）
分岐ルート9：第51話 ～ 第54話
両ルートとも最終話はサイドプランシナリオなし。
通常ルート
第51話 タキシードは明日に舞う
ネロが出撃した状態でバースデイのHPを減らしてイベントを発生させる（TacP100）
第52話 無限の光
INFINITY撃破時に他の敵を全滅させている（TacP300）
第53話 死闘の先へ
2パターンあり。
- Zマスター撃破時に他の敵を全滅させている（TacP500）
- 上記未達成時（TacP300）
困難ルート
第51話 夢と復讐の果てに
ネロが出撃した状態でバースデイのHPを減らしてイベントを発生させる（TacP100）
第52話 可能性を超えて
ドモンの攻撃でデビルガンダムのHPを減らしてイベントを発生させる（TacP300）
第53話 死闘の果てに扉は開く
無条件でTacP500獲得。